docs: align all documentation with the new repo structure

Update agent protocols (.claude/agents, .github/agents), guides, runbooks and READMEs
to the post-restructure layout: .specify/{scripts,tests,security,config,templates,
governance,memory,level5-config} -> packages/casan-harness/...; docs/input +
golden-runs + traceability-map -> apps/okr/domain/...; drop AINative_OKR_CASAN5/ prefix.
Runtime-state paths (.specify/logs, .specify/agentops, .specify/level5/central-governance)
kept as-is. Historical evidence under docs/output/ left untouched (immutable run records).

Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>

.github/agents/protocols/hallucination-prevention-checklist.md

@@ -4,7 +4,7 @@ Giao thức này cung cấp bộ checklist bắt buộc để các Review Agents
 
 ## 1. Nguyên lý đối chiếu chéo (Grounding)
 - Không có bất kỳ chi tiết thiết kế hoặc logic code nào được phép tự ý phát minh nếu không có cơ sở chứng cứ rõ ràng từ:
-  - Tài liệu Yêu cầu nghiệp vụ (`docs/input/okr-requirement.md`).
+  - Tài liệu Yêu cầu nghiệp vụ (`apps/okr/domain/input/okr-requirement.md`).
   - Bản vẽ thiết kế Basic Design (`bd-*.md`) hoặc Detail Design (`dd-*.md`).
   - Tệp thông tin Context hiện tại (`pipeline-context.yaml`).